二級建造師兩年未注冊可能會有以下后果：

1. 資格證會被注銷，無法再繼續執業。

2. 如果期間有項目需要二級建造師，而此時持證人卻無法從事項目施工、管理工作，會給企業帶來損失。

3. 證書會被注銷，二級建造師證書失效，只能重新報考。

為了避免這些后果，您應該及時與當地相關部門或相關行業組織機構聯系，了解注冊的具體流程和要求，并及時提交所需的材料和證明。同時，您也應該關注二級建造師的相關政策和法規，以避免不必要的損失和風險。

二級建造師兩年未注冊可能會遇到以下常見問題：

1. 證書是否有效：二級建造師證書兩年內沒有注冊，只要考生滿足注冊條件，仍然可以注冊。

2. 注冊時間問題：如果已經超過兩年還未注冊，可以根據實際情況選擇繼續教育（考取增項）或注銷證書（重新找單位掛靠）。

3. 資格證書是否失效：二級建造師資格證書在未注冊情況下是有效的，不會因為未注冊而失效。

4. 繼續教育問題：如果考取增項的話，需要完成繼續教育才能注冊。

5. 單位是否認可：可能會遇到單位不認可二級建造師證書的問題，此時需要和單位溝通，或者尋找專業人士咨詢。

6. 注銷證書問題：如果選擇注銷證書，則需要尋找一家有資質的培訓機構進行學習，并通過考試。

此外，還可能有其他潛在的問題需要注意，建議咨詢當地人事考試中心或培訓機構尋求具體幫助。

如果二級建造師兩年未注冊，需要注意以下幾點：

1. 證書風險：如果三年內不注冊，二級建造師證書將失效。因此，應確保及時將證書注冊到合適的單位，以避免這種風險。

2. 及時變更注冊信息：為了防止證書被冒名注冊，應隨時關注企業與個人的相關信息，如名稱、地址、聯系方式等發生變更時，需要及時辦理信息變更手續。

3. 關注政策變化：注冊過程中，應隨時關注政策法規和地方政策變化，確保自己的行為符合要求。

4. 證書使用：二級建造師證書作為執業資格證書，應該僅在授權范圍內在授權范圍內使用，不得超范圍使用。

5. 關注掛靠風險：如果打算將證書掛靠，應選擇正規掛靠平臺和有實力的企業，確保自己的權益不受侵害。同時，應了解掛靠協議內容，確保自己與雇主雙方的權益。

6. 保持證書有效性：應確保二級建造師證書的有效性，定期參加繼續教育、培訓等活動，以保持專業知識和技能的更新。

總之，二級建造師兩年未注冊需要注意證書風險、及時變更注冊信息、關注政策變化、保持證書有效性等事項。在注冊過程中，應選擇正規的注冊平臺和有實力的企業，確保自己的權益不受侵害。