二級建造師掛靠的缺點包括：

1. 風險的不確定性：掛靠者與建造師企業簽訂的掛靠協議并不具有勞動合同的特性，因掛靠協議并不需要注冊企業，也沒有實際用工和生產，所以掛靠協議并不受《勞動合同法》保護。如果掛靠者沒有通過注冊企業的安全培訓或與企業的其他額外約定，那么掛靠者與注冊企業并沒有建立勞動關系，一旦發生事故或涉及工程質量問題時，掛靠者就要自負其責。

2. 風險大：由于掛靠者與注冊企業并沒有建立勞動關系，所以注冊企業不會為掛靠者辦理五險一金，那么掛靠者所發生的意外與企業無關，工傷保險不能有效保障。

3. 證書難以維護：由于證書掛靠沒有簽訂正式勞動合同，沒有社保關系，所以證書難以得到有效維護。

4. 費用問題：如果掛靠者需要考取相關建筑類證書，那么證書的考取、繼續教育、培訓等費用都需要自己承擔。

請注意，這些缺點并非所有企業和個人都會遇到，也并非一定會發生。具體情況會根據個人和企業的情況有所不同。此外，這些缺點并非二級建造師掛靠的普遍情況，而是可能出現的一些問題。二級建造師掛靠仍然有許多優點，如降低考試難度、提高證書使用率等。在選擇掛靠時，建議仔細閱讀相關協議，選擇正規渠道，以降低風險。

二級建造師掛靠的常見問題包括：

1. 風險一：證書掛靠行業沒有明確的法律保護，相關法規空白，由雙方自行約定，因此存在很大的風險性。一旦出現糾紛，掛靠方可能面臨既無法求得有效賠償，又無法維權的風險。

2. 風險二：掛靠者與被掛靠者均有可能違反法律規定。掛靠者可能以被掛靠者的名義從事相關活動，被掛靠者則可能超出自身資質或者以不正當的手段來獲取資質，從而進行相關活動。

3. 風險三：證書掛靠后，由于資質到期，需要繼續掛靠，雙方需要重新簽訂協議，到期后也未必能順利續簽。

4. 風險四：如果掛靠者沒有通過正規途徑，直接將證書掛靠到被掛靠企業的，那么該企業會將證書用于資質申請、升級等事項，如果申請或升級失敗，則會給證書持有人帶來風險。

此外，二級建造師掛靠的缺點還包括證書無法使用、風險高、周期長、費用高等問題。具體來說，如果需要使用二級建造師證書，就必須將證書從注冊地轉到工作地，這個過程需要一定的時間，而且存在證書無法使用的情況。此外，掛靠證書存在一定的風險，需要與公司簽訂合同，明確雙方的權利和義務，并且證書的注冊周期較長，通常需要一年左右的時間。同時，支付一定的掛靠費用也是必要的。

以上內容僅供參考，建議咨詢專業人士獲取更準確的信息。

二級建造師掛靠的缺點主要有以下幾點：

1. 風險的不確定性：由于風險存在和發生的不確定性，二級建造師掛靠在很大程度上需要自己承擔風險。

2. 證書需要妥善保管：由于是掛靠，證書的安全性尤為重要。如果證書遺失或者損壞，將會帶來很大的損失。

3. 涉及到法律風險：如果與用證單位發生利益糾紛，證書持有者將可能承擔法律風險。

4. 收入不穩定：由于是短期合作，收入也可能會不太穩定。

為了盡量避免這些缺點，需要注意以下幾點：

1. 了解清楚合同條款：在掛靠之前，需要詳細了解合同的條款，包括權利和義務、費用、違約責任等等。確保合同條款對自己有利，并確保自己能夠遵守和履行。

2. 選擇信譽良好的企業：選擇有良好信譽和口碑的企業掛靠，可以降低風險。可以通過網絡搜索、朋友推薦等方式了解企業的信譽情況。

3. 簽訂正式的合同：合同是約束雙方權益的重要依據，應該選擇正式的合同方式，避免口頭協議和不規范的合同條款。

4. 保管好證書：證書是掛靠的核心，應該妥善保管好證書原件，避免遺失或者損壞。

5. 及時溝通和處理問題：在掛靠過程中，應該及時與用證單位溝通和處理遇到的問題，確保雙方權益不受損害。

總之，二級建造師掛靠需要謹慎對待，了解清楚合同條款、選擇信譽良好的企業、簽訂正式的合同、保管好證書等注意事項可以降低風險。